Derleme


DOI :10.26650/JARHS2020-S1-0003   IUP :10.26650/JARHS2020-S1-0003    Tam Metin (PDF)

COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi

Sevde HasanoğluEmrah Yücesan

2019 yılının Aralık ayında nedeni belirlenememiş bir pnömoni vakası Çin’de Wuhan şehrinde bildirilmiştir ve ardından bu hastalık COVID-19 olarak isimlendirilmiştir. 2020 yılının Mart ayında Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) tarafından COVID-19 hastalığı pandemi olarak ilan edilmiştir. DSÖ tarafından asemptomatik ya da hafif semptomlu vakalarda polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniğinin tanı koyma amacıyla uygulanabileceği belirtilmiştir. Ülkemizde, SARS-CoV2 kesin tanısının konması amacıyla gerçek zamanlı PCR (RT-PCR) uygulamaları DSÖ’nün kılavuzunda belirttiği ve Sağlık Bakanlığı’nın onayladığı şekilde gerçekleştirilmektedir. Bu derlemede, COVID-19 hastalığına neden olan SARS-COV-2 virüsünün RT-PCR ile tespitine ilişkin süreç özetlenmektedir

DOI :10.26650/JARHS2020-S1-0003   IUP :10.26650/JARHS2020-S1-0003    Tam Metin (PDF)

Detection of SARS-COV-2 Virus Causing COVID-19 Disease by Real-Time Polymerase Chain Reaction

Sevde HasanoğluEmrah Yücesan

In December 2019, an undetermined cause of pneumonia was reported in the city of Wuhan in China, and then this disease was named COVID-19. In March 2020, COVID-19 disease was declared as a pandemic by the World Health Organization (WHO). It has been stated by WHO that the polymerase chain reaction technique may be applied for diagnosis in asymptomatic or mild symptomic cases. In our country, RT-PCR applications are carried out in accordance with the WHO guideline and approved by the Ministry of Health in order to make a exact diagnosis of SARS-CoV2. This review summarizes the process of detecting SARS-COV-2 virus by RT-PCR, which causes COVID-19 disease.


PDF Görünüm

Referanslar

  • 1. Williams JV. (2005): The clinical presentation and outcomes of children infected with newly identified respiratory tract viruses. Infect Dis Clin North Am 19(3):569-84. google scholar
  • 2. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003 [cited 2020 April]. Available from: https:// www.who.int/csr/sars/en/. google scholar
  • 3. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). 2019 [cited 2020 April]. Available from: https://www.who.int/emergencies/merscov/en/. google scholar
  • 4. Peiris JS, Yuen KY, Osterhaus AD, Stöhr K. The severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med 2003;349:2431-41. DOI: 10.1056/ NEJMra032498 google scholar
  • 5. Zhao Z, Zhang F, Xu M, Huang K, Zhong W, Cai W, et al., Description and clinical treatment of an early outbreak of severe acute respiratory syndrome (SARS) in Guangzhou, PR China. J Med Microbiol 2003;52(Pt 8):715-20. google scholar
  • 6. Lee N, Hui D, Wu A, Chan P, Cameron P, Joynt GM et al., A major outbreak of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl J Med 2003;348(20):1986-1994. google scholar
  • 7. Suwantarat N, Apisarnthanarak A. Risks to healthcare workers with emerging diseases: lessons from MERS-CoV, Ebola, SARS, and avian flu. Curr Opin Infect Dis 2015;28(4):349-61. google scholar
  • 8. Zaki AM, van Boheemen S, Bestebroer TM, Osterhaus AD, Fouchier RA. Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N Engl J Med 2012;367(19):1814-20. google scholar
  • 9. Bialek SR, Allen D, Alvarado-Ramy F, Arthur R, Balajee A, Bell D, et al., First confirmed cases of Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) infection in the United States, updated information on the epidemiology of MERS-CoV infection, and guidance for the public, clinicians, and public health authorities - May 2014. MMWR Morb Mortal Wkly Rep., 2014;63(19):431-6. google scholar
  • 10. Ki M. 2015 MERS outbreak in Korea: hospitalto-hospital transmission. Epidemiol Health 2015; 37: e2015033. google scholar
  • 11. Lu L, Liu Q, Du L, Jiang S. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV): challenges in identifying its source and controlling its spread. Microbes Infect 2013;15(8-9):625-9. google scholar
  • 12. Donnelly CA, Malik MR, Elkholy A, Cauchemez S, Van Kerkhove MD. Worldwide Reduction in MERS Cases and Deaths since 2016. Emerg Infect Dis., 2019;25(9):1758-1760. google scholar
  • 13. Casanova LM, Jeon S, Rutala WA, Weber DJ, Sobsey MD. Effects of air temperature and relative humidity on coronavirus survival on surfaces. Appl Environ Microbiol 2010;76(9):2712-7. google scholar
  • 14. Pyankov OV, Bodnev SA, Pyankova OG, Agranovski IE. Survival of aerosolized coronavirus in the ambient air. J Aerosol Sci 2018;115:158-63. google scholar
  • 15. Otter JA, Donskey C, Yezli S, Douthwaite S, Goldenberg SD, Weber DJ. Transmission of SARS and MERS coronaviruses and influenza virus in healthcare settings: the possible role of dry surface contamination. J Hosp Infect 2016;92(3):235-50. google scholar
  • 16. Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol 2020;5(4):536-544. google scholar
  • 17. Cucinotta D, Vanelli M. (2020): WHO Declares COVID-19 a Pandemic. Acta Biomed 2020;91(1):157-60. google scholar
  • 18. McBride R, Fielding BC. The role of severe acute respiratory syndrome (SARS)-coronavirus accessory proteins in virus pathogenesis. Viruses, 2012;4(11):2902-23. google scholar
  • 19. Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG, et al., A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature, 2020;579(7798):265-9. google scholar
  • 20. Phan T. Novel coronavirus: From discovery to clinical diagnostics. Infect Genet Evol 2020;79:104211. google scholar
  • 21. Yin Y, Wunderink RG. MERS, SARS and other coronaviruses as causes of pneumonia. Respirology 2018;23(2):130-7. google scholar
  • 22. Chen Y, Liu Q, Guo D. Emerging coronaviruses: Genome structure, replication, and pathogenesis. J Med Virol 2020;92(4):418-23. google scholar
  • 23. Chang L, Yan Y, Wang L. Coronavirus Disease 2019: Coronaviruses and Blood Safety. Transfus Med Rev., Feb 21 2020. pii: S08877963(20)30014-6. google scholar
  • 24. Enjuanes L, Zuñiga S, Castaño-Rodriguez C, Gutierrez-Alvarez J, Canton J, Sola I. Molecular Basis of Coronavirus Virulence and Vaccine Development. Adv Virus Res 2016;96:245-86. google scholar
  • 25. Ding Y, Wang H, Shen H, Li Z, Geng J, Han H, et al., The clinical pathology of severe acute respiratory syndrome (SARS): a report from China. J Pathol., 2003;200(3):282-9. google scholar
  • 26. Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, et al., A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N Engl J Med 2020;382(8):727-33. google scholar
  • 27. Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, et al., (2020): Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet, 2020;395(10223):497-506. google scholar
  • 28. Laboratory testing for coronavirus disease 2019 (COVID-19) in suspected human cases. 2020 [cited 2020 April]. Available from: https://apps. who.int/iris/handle/10665/331329. google scholar
  • 29.man coronavirus by real-time reverse-transcription polymerase chain reaction. Euro Surveill, 2012;17(39). pii: 20285. google scholar
  • 30. Pas SD, Patel P, Reusken C, Domingo C, Corman VM, Drosten C, et al., First international external quality assessment of molecular diagnostics for Mers-CoV. J Clin Virol., 2015;69:81-5. google scholar

Atıflar

Biçimlendirilmiş bir atıfı kopyalayıp yapıştırın veya seçtiğiniz biçimde dışa aktarmak için seçeneklerden birini kullanın


DIŞA AKTAR



APA

Hasanoğlu, S., & Yücesan, E. (2020). COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 3(1), 24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


AMA

Hasanoğlu S, Yücesan E. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi. 2020;3(1):24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


ABNT

Hasanoğlu, S.; Yücesan, E. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, [Publisher Location], v. 3, n. 1, p. 24-30, 2020.


Chicago: Author-Date Style

Hasanoğlu, Sevde, and Emrah Yücesan. 2020. “COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 3, no. 1: 24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


Chicago: Humanities Style

Hasanoğlu, Sevde, and Emrah Yücesan. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 3, no. 1 (Mar. 2024): 24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


Harvard: Australian Style

Hasanoğlu, S & Yücesan, E 2020, 'COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi', Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 3, no. 1, pp. 24-30, viewed 29 Mar. 2024, https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


Harvard: Author-Date Style

Hasanoğlu, S. and Yücesan, E. (2020) ‘COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi’, Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 3(1), pp. 24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003 (29 Mar. 2024).


MLA

Hasanoğlu, Sevde, and Emrah Yücesan. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 3, no. 1, 2020, pp. 24-30. [Database Container], https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003


Vancouver

Hasanoğlu S, Yücesan E. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi [Internet]. 29 Mar. 2024 [cited 29 Mar. 2024];3(1):24-30. Available from: https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003 doi: 10.26650/JARHS2020-S1-0003


ISNAD

Hasanoğlu, Sevde - Yücesan, Emrah. COVID-19 Hastalığına Neden Olan SARS-COV-2 Virüsünün Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi”. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 3/1 (Mar. 2024): 24-30. https://doi.org/10.26650/JARHS2020-S1-0003



ZAMAN ÇİZELGESİ


Gönderim24.04.2020
Kabul30.04.2020
Çevrimiçi Yayınlanma15.05.2020

LİSANS


Attribution-NonCommercial (CC BY-NC)

This license lets others remix, tweak, and build upon your work non-commercially, and although their new works must also acknowledge you and be non-commercial, they don’t have to license their derivative works on the same terms.


PAYLAŞ




İstanbul Üniversitesi Yayınları, uluslararası yayıncılık standartları ve etiğine uygun olarak, yüksek kalitede bilimsel dergi ve kitapların yayınlanmasıyla giderek artan bilimsel bilginin yayılmasına katkıda bulunmayı amaçlamaktadır. İstanbul Üniversitesi Yayınları açık erişimli, ticari olmayan, bilimsel yayıncılığı takip etmektedir.