Araştırma Makalesi


DOI :10.26650/JARHS2022-1142531   IUP :10.26650/JARHS2022-1142531    Tam Metin (PDF)

TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ

Bülent ÇakalMuzaffer ArıkanAlp AtasoyBilger ÇavuşMehveş PodaMesut BulakçıMine GüllüoğluMehmet DemirciFiliz Akyüz

Amaç Konak genetik faktörleri hepatit B virüs (HBV) enfeksiyonunun doğal seyri ve HBV ilişkili karaciğer hastalıklarının gelişme riski ile progresyonu üzerinde etkili olabilmektedir. Bu çalışmada HLA-DQ gen rs9272105, rs2856718 ve rs9275572 polimorfizmlerinin HBV doğal klirensi, viral yük ve HBV ile ilişkili karaciğer hasarı gelişimi ile ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem Çalışmaya 150 kronik hepatit B (KHB) hastası ile kontrol grubu olarak 58’i kronik hepatit C (KHC) ve 82’si farklı klinik endikasyonlar nedeniyle karaciğer biyopsi işlemi gerçekleştirilen 140 hasta dâhil edildi. HLA-DQ rs9272105, rs2856718 ve rs9275572 genotip ve polimorfizmlerinin belirlenmesinde TaqMan SNP genotiplendirme yöntemi kullanıldı. Bulgular KHB’li ve kontrol grubundaki hastaların HLA-DQ gen rs9272105, rs2856718 ve rs9275572 genotip ve allel frekansları arasında farklılık tespit edildi (P<0,05). HLA-DQ rs9272105 AA genotip ve A allel varlığı, hepatit B yüzey antijen (Hepatitis B surface antigen; HBSAg) klirensi ve karaciğer hasarı ile ilişkiliydi (p<0,05). HLA-DQ gen rs2856718 ve rs9275572 ise HBV klirensi ve hastaların histolojik sonuçlarıyla ve ayrıca rs9272105 de dâhil hastaların viral yükleriyle ilişkili değildi. Sonuç HLA-DQ rs9272105 AA genotip ve A allel gerek HBV enfeksiyonunun kronikleşmesi gerekse HBV ilişkili karaciğer hasarının gelişmesi için risk faktördür.

DOI :10.26650/JARHS2022-1142531   IUP :10.26650/JARHS2022-1142531    Tam Metin (PDF)

ASSOCIATION OF HLA-DQ POLYMORPHISMS WITH HEPATITIS B VIRUS INFECTION IN TURKISH POPULATION

Bülent ÇakalMuzaffer ArıkanAlp AtasoyBilger ÇavuşMehveş PodaMesut BulakçıMine GüllüoğluMehmet DemirciFiliz Akyüz

Objective Host genetic factors can affect the natural course of hepatitis B virus (HBV) infection and the risk of development and progression of HBV-related liver diseases. The aim of this study is to evaluate the role of the HLA-DQ gene polymorphisms rs9272105, rs2856718 and rs9275572 with HBV natural clearance, viral load and the development of HBV associated liver injury. Materials and Methods The study included 150 patients with chronic hepatitis B (CHB) and 140 patients as the control group, 58 of whom had chronic hepatitis C (CHC) and 82 of whom had undergone a liver biopsy due to different clinical indications. The HLA-DQ gene rs9272105, rs2856718 and rs9275572 polymorphisms were genotypes in liver samples using the hybridization probe assay. Results A difference was found between the HLA-DQ gene rs9272105, rs2856718 and rs9275572 genotype and allele frequencies of the patients with CHB and the control group (P<0,05). The HLA-DQ rs9272105 AA genotype and presence of A allele were associated with hepatitis B surface antigen (HBsAg) clearance and liver injury (p<0,05). In contrast, the HLA-DQ genes rs2856718 and rs9275572 were not associated with HBV clearance and patients’ histological outcomes, nor with patients’ viral load, including rs9272105. Conclusions It has been suggested that the HLA-DQ rs9272105 AA genotype and the A allele are risk factors for both the persistence of HBV infection and the development of HBV-related liver damage.


PDF Görünüm

Referanslar

  • 1. Beasley RP. Hepatitis B virus: The major etiology of hepatocellular carcinoma. Cancer 1988;61:1942-56. google scholar
  • 2. Dunn R, Wetten A, McPherson S, Donnelly MC. Viral hepatitis in 2021: The challenges remaining and how we should tackle them. World J Gastroenterol 2022; 7;28(1):76-951. google scholar
  • 3. Xu J, Zhan Q, Fan Y, Yu Y, Zeng Z. Human genetic susceptibility to hepatitis B virus infection. Infection. Genetics and Evolution 2021;87:104663. doi: 10.1016/j.meegid.2020.104663. google scholar
  • 4. Zhang Z, Wang C, Liu Z, Zou G, Li J, Lu M. Host Genetic Determinants of Hepatitis B Virus Infection. Front Genet 2019;10:696. google scholar
  • 5. Zeng Z, Liu H, Xu H, Lu H, Yu Y, Xu X et al, HBV study consortium. Genome-wide association study identifies new loci associated with risk of HBV infection and disease progression. BMC Med Genomics 2021;14:84. google scholar
  • 6. Graves AM, Virdis F, Morrison E, Âlvaro-Benito M, Khan AA, Freund C et al. Human hepatitis B viral infection outcomes are linked to naturally occurring variants of HLA-DOA that have altered function. J Immunol 2020 15;205(4):923-35. google scholar
  • 7. Song Y, Xia T, Xia X, Zhang A-M. Genetic polymorphisms of the HLA-DP and HLA-DQ genes could influence Hepatitis B virus infection in Yunnan population. Immunol Invest 2021;50(1):47-57. google scholar
  • 8. Xu T, Zhu A, Sun M, Lv J, Qian Z, Wang X, Wang T, Wang H, et al. Quantitative assessment of HLA-DQ gene polymorphisms with the development of hepatitis B virus infection, clearance, liver cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. Oncotarget 2018; 9(1):96-109. google scholar
  • 9. Lv J, Xu T, Qian Z, Wang H et al. Association between HLA-DQ Gene Polymorphisms and HBV-Related Hepatocellular Carcinoma. Gastroenterol Res Pract 2017;2017:7150386. doi:10.1155/2017/7150386. google scholar
  • 10. Al-Qahtani A A, Al-Anazi MR, Abdo A A, Sanai FM, Al-Hamoudi W, Alswat KA, et al. Association between HLA variations and chronic hepatitis B virus infection in Saudi Arabian patients. PLoS ONE 2014;9(1):e80445. doi: 10.1371/journal.pone.0080445. google scholar
  • 11. Xu T,Sun M, Wang H. Relationship between HLA-DQ Gene Polymorphism and Hepatitis B Virus Infection. Biomed Res Int 2017;2017:9679843. doi: 10.1155/2017/9679843. google scholar
  • 12. Ishak K, Baptista A, Bianchi L, Calleo F, De Groote J, Gaudet F. Histological grading and staging of chronic hepatitis. J Hepatol 1995;22(6):696-9. google scholar
  • 13. Kozuka R, Enomoto M, Sato-Matsubara M, Yoshida K, Motoyama H, Hagihara A, et al. Association between HLA-DQA1/DRB1 polymorphism and development of hepatocellular carcinoma during entecavir treatment. J Gastroenterol Hepatol 2019;34(5):937-46. google scholar
  • 14. Wen J, Song C, Jiang D, Jin T, Dai J, Zhu L, et al. Hepatitis B virus genotype, mutations, human leukocyte antigen polymorphisms and their interactions in hepatocellular carcinoma: a multi-centre casecontrol study. Sci Rep 2015;16(5):16489. doi: 10.1038/ srep16489. google scholar
  • 15. Li S, Qian J, Yang Y, Zhao W, Dai J, Bei J-X et al. GWAS identifies novel susceptibility loci on 6p21.32 and 21q21.3 for hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis B virus carriers. PLoS Genet 2012;8:e1002791. doi: 10.1371/journal.pgen.1002791. google scholar
  • 16. Hsieh AR, Fann CSJ, Lin HC, Tai J, Hsieh SY, Tai DI. Hepatitis B virus persistent infection-related single nucleotide polymorphisms in HLA regions are associated with viral load in hepatoma families. World J Gastroenterol 2021;27(37):6262-76. google scholar
  • 17. Trinks J, Nishida N, Hulaniuk ML, Caputo M, Tsuchiura T, Marciano S, et al. Role of HLA-DP and HLA-DQ on the clearance of hepatitis B virus and the risk of chronic infection in a multiethnic population. Liver Int 2017;37(10):1476-87. google scholar
  • 18. Zhang X, Jia J, Dong J, Yu F,Ma N,Li M, et al. HLA-DQ polymorphisms with HBV infection: different outcomes upon infection and prognosis to lamivudine therapy. J Viral Hepat 2014;21(7):491-8. google scholar
  • 19. Mohammadi H, Alavian SM, Sharafi H. Association of single nucleotide polymorphisms in immune-related genes with spontaneous HBsAg seroconversion: A systematic review and meta-analysis. Int Immunopharmacology 2022;110:108982. doi: 10.1016/j.intimp.2022.108982. google scholar
  • 20. Ochi Y, Hashimoto S, Kawabe N, Murao M, Nakano T, et al. HLA-DQ gene polymorphisms are associated with hepatocellular carcinoma and hepatitis B surface antigen in chronic hepatitis B virus infection. Hepatol Res 2017;47(8):755-66. google scholar
  • 21. Ji X, Zhang Q, Li B, Dua Y, Yin J, Liu W. Impacts of human leukocyte antigen DQ genetic polymorphisms and their interactions with hepatitis B virus mutations on the risks of viral persistence, liver cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. Infect Genet Evol 2014;28:201-9. google scholar

Atıflar

Biçimlendirilmiş bir atıfı kopyalayıp yapıştırın veya seçtiğiniz biçimde dışa aktarmak için seçeneklerden birini kullanın


DIŞA AKTAR



APA

Çakal, B., Arıkan, M., Atasoy, A., Çavuş, B., Poda, M., Bulakçı, M., Güllüoğlu, M., Demirci, M., & Akyüz, F. (2022). TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 5(3), 186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


AMA

Çakal B, Arıkan M, Atasoy A, Çavuş B, Poda M, Bulakçı M, Güllüoğlu M, Demirci M, Akyüz F. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi. 2022;5(3):186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


ABNT

Çakal, B.; Arıkan, M.; Atasoy, A.; Çavuş, B.; Poda, M.; Bulakçı, M.; Güllüoğlu, M.; Demirci, M.; Akyüz, F. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, [Publisher Location], v. 5, n. 3, p. 186-192, 2022.


Chicago: Author-Date Style

Çakal, Bülent, and Muzaffer Arıkan and Alp Atasoy and Bilger Çavuş and Mehveş Poda and Mesut Bulakçı and Mine Güllüoğlu and Mehmet Demirci and Filiz Akyüz. 2022. “TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 5, no. 3: 186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


Chicago: Humanities Style

Çakal, Bülent, and Muzaffer Arıkan and Alp Atasoy and Bilger Çavuş and Mehveş Poda and Mesut Bulakçı and Mine Güllüoğlu and Mehmet Demirci and Filiz Akyüz. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 5, no. 3 (Apr. 2024): 186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


Harvard: Australian Style

Çakal, B & Arıkan, M & Atasoy, A & Çavuş, B & Poda, M & Bulakçı, M & Güllüoğlu, M & Demirci, M & Akyüz, F 2022, 'TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ', Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 5, no. 3, pp. 186-192, viewed 24 Apr. 2024, https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


Harvard: Author-Date Style

Çakal, B. and Arıkan, M. and Atasoy, A. and Çavuş, B. and Poda, M. and Bulakçı, M. and Güllüoğlu, M. and Demirci, M. and Akyüz, F. (2022) ‘TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ’, Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 5(3), pp. 186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531 (24 Apr. 2024).


MLA

Çakal, Bülent, and Muzaffer Arıkan and Alp Atasoy and Bilger Çavuş and Mehveş Poda and Mesut Bulakçı and Mine Güllüoğlu and Mehmet Demirci and Filiz Akyüz. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 5, no. 3, 2022, pp. 186-192. [Database Container], https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531


Vancouver

Çakal B, Arıkan M, Atasoy A, Çavuş B, Poda M, Bulakçı M, Güllüoğlu M, Demirci M, Akyüz F. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi [Internet]. 24 Apr. 2024 [cited 24 Apr. 2024];5(3):186-192. Available from: https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531 doi: 10.26650/JARHS2022-1142531


ISNAD

Çakal, Bülent - Arıkan, Muzaffer - Atasoy, Alp - Çavuş, Bilger - Poda, Mehveş - Bulakçı, Mesut - Güllüoğlu, Mine - Demirci, Mehmet - Akyüz, Filiz. TÜRKİYE POPÜLASYONUNDA HLA-DQ POLİMORFİZMLERİNİN HEPATİT B VİRÜS ENFEKSİYONU İLE İLİŞKİSİ”. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 5/3 (Apr. 2024): 186-192. https://doi.org/10.26650/JARHS2022-1142531



ZAMAN ÇİZELGESİ


Gönderim08.07.2022
Kabul10.10.2022
Çevrimiçi Yayınlanma28.10.2022

LİSANS


Attribution-NonCommercial (CC BY-NC)

This license lets others remix, tweak, and build upon your work non-commercially, and although their new works must also acknowledge you and be non-commercial, they don’t have to license their derivative works on the same terms.


PAYLAŞ




İstanbul Üniversitesi Yayınları, uluslararası yayıncılık standartları ve etiğine uygun olarak, yüksek kalitede bilimsel dergi ve kitapların yayınlanmasıyla giderek artan bilimsel bilginin yayılmasına katkıda bulunmayı amaçlamaktadır. İstanbul Üniversitesi Yayınları açık erişimli, ticari olmayan, bilimsel yayıncılığı takip etmektedir.