Araştırma Makalesi

DOI :10.26650/JARHS2025-1765794 IUP :10.26650/JARHS2025-1765794 Tam Metin (PDF)

Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri

Servet Tunoğlu, Gamze Nur Öter, Sevda Tanrıkulu Küçük

Amaç: Bu çalışmada, insan prostat kanseri hücre hatlarında (PC3, DU145, LNCaP) ve normal prostat epitel hücrelerinde (PNT1A) uzun olmayan kodlayıcı RNA H19 ve mikroRNA-29b-3p (miR-29b-3p) düzeylerinin incelenmesi ve bu moleküllerin prostat kanseri biyolojisindeki potansiyel rolleri ve etkileşimlerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntem: PC3, DU145, LNCaP ve PNT1A hücre hatları belirlenmiş protokole göre kültüre edilmiştir. Hücreler konfluansa ulaştığında toplam RNA ekstrakte edilmiştir. H19 ve miR-29b-3p ekspresyon düzeyleri RT-qPCR yöntemi ile ölçülmüş ve sırasıyla GAPDH ve U6 snRNA’ya göre normalize edilmiştir. Göreli gen ekspresyon düzeylerini belirlemek için 2-ΔΔCt yöntemi uygulanmıştır.

Bulgular: lncRNA H19 ve miR-29b-3p düzeylerindeki değişiklikler, tüm kanser hücre hatlarında PNT1A hücrelerine kıyasla istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. H19 düzeyleri PC3'te belirgin şekilde yüksek, DU145’te orta derecede artmış, LNCaP'ta ise anlamlı şekilde azalmıştır. Tersine, miR-29b-3p düzeyleri DU145 ve LNCaP'ta artarken, PC3’te belirgin şekilde azalmıştır. İstatistiksel analizler özellikle H19 için PC3 ile diğer hücre hatları arasında ve miR-29b-3p için PC3 ile DU145 arasında anlamlı farklılıklar olduğunu göstermiştir (p<0,05).

Sonuç: Bulgularımız, PC3 hücrelerinde H19 ile miR-29b-3p arasında negatif bir korelasyon olduğunu göstermektedir; bu durum, H19’un miR-29b-3p için moleküler bir sünger görevi görebileceğini düşündürmektedir. LNCaP ile diğerleri arasında gözlemlediğimiz ekspresyon düzeyi farklılıkları, H19–miR-29b-3p ekseninin androjen reseptörü sinyallemesi ve tümör agresifliğinden etkilenebileceğini göstermektedir. Altta yatan mekanizmayı ve olası klinik önemini daha iyi anlayabilmek için ilave fonksiyonel çalışmalara ihtiyaç vardır.

Anahtar Kelimeler: Prostat kanseri, lncRNA H19, miR-29b-3p, Gen ekspresyonu, ceRNA ağı, Tümör progresyonu

DOI :10.26650/JARHS2025-1765794 IUP :10.26650/JARHS2025-1765794 Tam Metin (PDF)

Expression Profiles of lncRNA H19 and miR-29b-3p in Prostate Cancer Cell Lines

Servet Tunoğlu, Gamze Nur Öter, Sevda Tanrıkulu Küçük

Objective: We aimed to evaluate the expression levels of long non-coding RNA H19 and microRNA-29b-3p (miR-29b-3p) in human prostate cancer cell lines (PC3, DU145, LNCaP) and in normal prostate epithelial cells (PNT1A) to explore their potential roles and interactions in prostate cancer biology.

Materials and Methods: All cell lines PC3, DU145, LNCaP, and PNT1A were cultured in the same type of medium, RPMI-1640. Total RNA was extracted from the cells once they reached confluency. H19 and miR-29b-3p levels were measured by real-time quantitative PCR and normalised to GAPDH and U6 snRNA, respectively. Their relative level was determined by the 2-ΔΔCt method.

Results: The alterations in lncRNA H19 and miR-29b-3p levels were statistically significant across all cancer cell lines compared to PNT1A cells. H19 levels were notably higher in PC3, moderately increased in DU145, and significantly decreased in LNCaP. Conversely, miR-29b-3p levels increased in DU145 and LNCaP but decreased markedly in PC3. Statistical analysis particularly showed significant differences between PC3 and other cell lines for lncRNA H19 and between PC3 and DU145 for miR-29b-3p (p<0.05).

Conclusion: Our findings show an inverse relationship between H19 and miR-29b-3p in PC3 cells, indicating that H19 may function as a molecular sponge for miR-29b-3p. The differences we observed in the expression levels between LNCaP and the others show that the H19–miR-29b-3p axis may be affected by androgen receptor signalling and tumour aggressiveness. To better understand the underlying mechanism and its potential clinical relevance, additional functional studies are necessary.

Anahtar Kelimeler: Prostate cancer, lncRNA H19, miR-29b-3p, Gene expression, ceRNA network, Tumour progression

Referanslar

Bray F, Laversanne M, Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Soerjomataram I, et al. Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin 2024;74(3):229-63. google scholar
Absalan S, Vaziri H. The role of non-coding RNAs (ncRNAs) and their potential connection with cancer. Egypt J Med Hum Genet 2025;26(1):55. google scholar
Zhou YL, Yao WL, Chen SH, Wang P, Fu JW, Zhao JQ, et al. Global research landscape and emerging trends of non-coding RNAs in prostate cancer: a bibliometric analysis. Front Pharmacol 2025;15:1483186. google scholar
Ke Z, Hu X, Liu Y, Shen D, Khan MI, Xiao J. Updated review on analysis of long non-coding RNAs as emerging diagnostic and therapeutic targets in prostate cancers. Crit Rev Oncol Hematol 2024;196:104275. google scholar
Ivanovic RF, Viana NI, Morais DR, Silva IA, Leite KR, Pontes-Junior J, et al. miR-29b enhances prostate cancer cell invasion independently of MMP-2 expression. Cancer Cell Int 2018;18(1):18. google scholar
Zhao J, Ma X, Xu H. miR-29b-3p inhibits 22Rv1 prostate cancer cell proliferation through the YWHAE/BCL-2 regulatory axis. Oncol Lett 2022;24(2):289. google scholar
Man X, Li Q, Wang B, Zhang H, Zhang S, Li Z. DNMT3A and DNMT3B in breast tumorigenesis and potential therapy. Front Cell Dev Biol 2022;10:916725. google scholar
Lv M, Zhong Z, Huang M, Tian Q, Jiang R, Chen J. lncRNA H19 regulates epithelial–mesenchymal transition and metastasis of bladder cancer by miR-29b-3p as competing endogenous RNA. Biochim Biophys Acta Mol Cell Res 2017;1864(10):1887-99. google scholar
Yan B, Guo Q, Nan XX, Wang Z, Yin Z, Yi L, et al. MicroRNA-29b inhibits cell proliferation and invasion and enhances apoptosis and chemotherapy effects of cisplatin via targeting of DNMT3b and AKT3 in prostate cancer. Onco Targets Ther 2015;8:557-65. google scholar
Li JH, Liu S, Zhou H, Qu LH, Yang JH. starBase v2.0: decoding miRNA-ceRNA, miRNA-ncRNA and protein–RNA interaction networks from large-scale CLIP-Seq data. Nucleic Acids Res 2014;42(D1):D92-7. google scholar
Singh N, Ramnarine VR, Song JH, Pandey R, Padi SKR, Nouri M, et al. The long noncoding RNA H19 regulates tumor plasticity in prostate cancer. Nat Commun 2021;12:7349. google scholar
Liu L, Liu L, Lu S. lncRNA H19 promotes viability and epithelial–mesenchymal transition of lung adenocarcinoma cells by targeting miR-29b-3p and modifying STAT3. Int J Oncol 2019;54(3):929-41. google scholar
Ren X, Liu G, Zhou J. Nuclear-activating miRNAs: unveiling the intricacies of subcellular miRNA function and regulation in cancer and immunity disease. Cancer Cell Int 2025;25(1):147. google scholar
Sur S, Steele R, Ray RB. miRNA-29b inhibits prostate tumor growth (in vivo). Cells 2019;8:1455. google scholar
Elimam H, Zaki MB, Abd-Elmawla MA, Darwish HA, Hatawsh A, Aborehab NM, et al. Natural products and long non-coding RNAs in prostate cancer: insights into etiology and treatment resistance. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol 2025;398:1-20. google scholar
Thomson DW, Dinger ME. Endogenous microRNA sponges: evidence and controversy. Nat Rev Genet 2016;17:272-83. google scholar
Zhang X, Wang G, Li X, Liu Y, Wu X, Zhou Y, et al. LncRNA H19 promotes gastric cancer metastasis via miR-148-3p/SOX-12 axis. Anal Cell Pathol 2024;2024(1):6217134. google scholar
El Sayed SR, Cristante J, Guyon L, Denis J, Chabre O, Cherradi N. MicroRNA therapeutics in cancer: current advances and challenges. Cancers (Basel) 2021;13(11):2680. google scholar

Atıflar

Biçimlendirilmiş bir atıfı kopyalayıp yapıştırın veya seçtiğiniz biçimde dışa aktarmak için seçeneklerden birini kullanın

DIŞA AKTAR

APA

Tunoğlu, S., Öter, G.N., & Tanrıkulu Küçük, S. (2019). Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 0(0), -. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

AMA

Tunoğlu S, Öter G N, Tanrıkulu Küçük S. Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi. 2019;0(0):-. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

ABNT

Tunoğlu, S.; Öter, G.N.; Tanrıkulu Küçük, S. Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, [Publisher Location], v. 0, n. 0, p. -, 2019.

Chicago: Author-Date Style

Tunoğlu, Servet, and Gamze Nur Öter and Sevda Tanrıkulu Küçük. 2019. “Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 0, no. 0: -. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

Chicago: Humanities Style

Tunoğlu, Servet, and Gamze Nur Öter and Sevda Tanrıkulu Küçük. “Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 0, no. 0 (Sep. 2025): -. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

Harvard: Australian Style

Tunoğlu, S & Öter, GN & Tanrıkulu Küçük, S 2019, 'Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri', Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 0, no. 0, pp. -, viewed 25 Sep. 2025, https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

Harvard: Author-Date Style

Tunoğlu, S. and Öter, G.N. and Tanrıkulu Küçük, S. (2019) ‘Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri’, Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, 0(0), pp. -. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794 (25 Sep. 2025).

MLA

Tunoğlu, Servet, and Gamze Nur Öter and Sevda Tanrıkulu Küçük. “Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri.” Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi, vol. 0, no. 0, 2019, pp. -. [Database Container], https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

Vancouver

Tunoğlu S, Öter GN, Tanrıkulu Küçük S. Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi [Internet]. 25 Sep. 2025 [cited 25 Sep. 2025];0(0):-. Available from: https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794 doi: 10.26650/JARHS2025-1765794

ISNAD

Tunoğlu, Servet - Öter, GamzeNur - Tanrıkulu Küçük, Sevda. “Prostat Kanseri Hücre Hatlarında lncRNA H19 ve miR-29b-3p Ekspresyon Profilleri”. Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi 0/0 (Sep. 2025): -. https://doi.org/10.26650/JARHS2025-1765794

ZAMAN ÇİZELGESİ

Gönderim	18.08.2025
Kabul	03.09.2025
Çevrimiçi Yayınlanma	19.09.2025

LİSANS

Attribution-NonCommercial (CC BY-NC)

This license lets others remix, tweak, and build upon your work non-commercially, and although their new works must also acknowledge you and be non-commercial, they don’t have to license their derivative works on the same terms.

Sağlık Bilimlerinde İleri Araştırmalar Dergisi